據中央社等媒體報導，菲利普斯和嚮導佩雷拉本月5日在亞馬遜森林的偏遠地區失蹤，當地充斥環境犯罪，例如非法採礦、捕魚及伐木，還有毒品走私。
媒體報導，警方周三稍早把一名涉案嫌犯帶到伊塔瓜伊河（Itaquai River）旁的搜索地點。稍後，巴西司法部長托瑞斯於推特發文說：「我剛接到消息得知，在挖掘的地方發現了人類遺骸。」
媒體先前報導，兩名被拘留的男子告訴警方，菲利普斯和佩雷拉已經被殺，同時坦承涉案。當局當時尚未證實報導是否屬實。
法新社周三報導，被警方帶到挖掘現場的涉案人是41歲的奧塞尼．奧里維拉，他周二在北阿塔拉亞被捕。菲利普斯與佩雷拉在採訪途中遭人威脅、繼而失蹤於偏僻的野豬谷（Javari Valley）之前，原本正要回到這座北方小城。
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另一名被拘留的男子據報是奧塞尼．奧里維拉的兄弟阿馬里多．奧里維拉，於本月7日被捕，但他一直否認與案件有關。
聯邦警方周三表示，阿馬里多詳細敘述罪行，坦承把兩人埋在叢林裡一個「非常難以到達」的地方。
「很多人不喜歡他，應更加小心」
57歲的菲利普斯長期為英國《衛報》等國際媒體供稿，他已在巴西居住十多年，失蹤前正為了一本有關亞馬遜永續發展的書取材。佩雷拉則是備受尊敬的原住民族倡議人士，失蹤前擔任菲利普斯的嚮導。
外界指責政府調查進度緩慢，博索納羅周三說，菲利普斯因為在這個地區的報導而「不受歡迎」，應該更加謹慎。這番話又引來新一波批評。
博索納羅接受記者訪問時說：「那個英國人不受當地歡迎，因為他寫了很多反對非法金礦工人（和）環境議題的文章……很多人不喜歡他，他應該更加小心，卻偏偏決定上路。」
博索納羅說：「所有跡象都顯示，如果他們被殺──我是不希望這樣，但如果他們被殺，會在水裡，而水裡找不到什麼東西，我不知道查瓦利（Javari）河裡有沒有食人魚。」
博索納羅似乎再次怪罪菲利普斯與佩雷拉，說他們「在體能和武器方面沒有充分準備就前往那個地區，非常莽撞」。
博索納羅的言論引發譴責批評，記者巴希里歐推文說「有夠噁心」，反對黨國會議員席瓦也說：「要怪的不是受害者。政府有義務保護國家，而不是鼓勵控制這個地區的罪犯。」
自失蹤以來，菲利普斯和佩雷拉的家人一直在痛苦地等待消息。菲利普斯的朋友亨利克·庫里表示，菲利普斯的親友都對他的失蹤異常震驚，「他是一個可愛和溫柔的人，在巴西有很多朋友。」菲利普斯的太太則表示需要尋求公義，希望調查可以包括所有的可能性，儘可能帶出所有相關的答案。
據庫里稱，菲利普斯失蹤前曾說，他希望去亞馬遜西部看看，然後向世界展示亞馬遜的全貌。
或與非法捕魚或毒品販賣有關
美聯社指出，巴西當局認為，這起事件的背後是一項跨國盜獵活動。特定組織付錢給貧窮的漁民，要求漁民在巴西第二大原住民保護區野豬谷捕魚，最有價值的獵物是巨骨舌魚（arapaima），這是世界最大型淡水魚之一，身長可達3公尺、最重可達200公斤以上。
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{nextpage}佩雷拉曾多次帶領巴西政府原住民基金會（FUNAI）進行打擊非法捕魚的行動，扣押非法盜獵漁民的工具、並處以罰款和短暫拘留。據巴西法律，只有原住民可以在其保護區內捕魚。
除了取締捕魚而結怨，警方也不排除販毒組織涉案的關聯性。《華盛頓郵報》指出，菲利普斯的遇害可能和當地的非法捕魚或毒品販賣有關。
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